Лампочка очень инерционна (пока спираль нагреется, пока остынет - пройдут десятые доли секунды), вот глаз мерцание и не замечает.
Светодиоды имеют очень высокое быстродействие, на хороших можно заметить даже низкочастотное ШИМ-управления яркостью (будут мерцать), не говоря уже о мелких сбоях в питании.
Бороться можно LC-фильтром (дросселем последовательно и конденсатором параллельно). Чтоб компактно было - дроссель 0,1-0,22 мкГн (он размером с резистор на фотке) и конденсатором для поверхностного монтажа (например, типоразмера 0832 или 1632 - чтоб прям поверх выводов напаять можно было) емкостью от 0,05 мкФ (хотя я бы посмотрел 0,22 или даже 0,47 мкф, если эти диоды не используются в роли стробов или марсов)...
UPD:
защитный диод в корпусе светодиода защищает от высокого подачи обратного напряжения (оно особенно опасно для синих и белых диодов), и не имеет никакого отношения к мерцанию.