Только надо учитывать, что посадить новую фрезу идеально - та еще задача (CNC обычно умеют это делать).
Поэтому в промышленности на "простых" фрезерах с ЧПУ обычно делают "черновую" фрезеровку с приличным припуском, а потом долго и упорно возюкают "чистовой" фрезой, снимая этот припуск.P.S. Не могу сказать за все станки, но на некотором железе (драйверах шаговиков, которые управляют перемещением) можно делать "калибровку" - "мач" самой грубой фрезой в "мертвой" зоне заготовки высверливает специальный маркер, а после установки других фрез аккуратно постукивает ими о кромки маркера, определяя диаметр и высоту установки фрезы. Но, в принципе, когда речь не идет о точности лучше 0,2-0,3 мм - проще задать размеры инструмента при конвертации модели в формат, понятный станку...