Игорь, в папке C:\Users\ИМЯ ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ\AppData\Local\Google\Chrome\User Data\Default ищи файл Bookmarks.bak - это сохраненная предыдущая версия файла закладок
Сам файл с закладками имеет имя Bookmarks, лежит там же - его куда-нибудь временно перепиши себе.
Переименовываем Bookmarks.bak в Bookmark, перегружаем Хром и смотрим что получится.