Со своей стороны замечу, что относительно тонкие стенки имеют меньше внутренних напряжений и достаточно пластичны. Думаю, что достаточно просто склеить корпус с крышей, выровняв край стенок в момент склеивания, и всё будет нормально. Вот, к примеру, одна из первых тестовых печатей - как склеил полгода назад, так все на месте и осталось...

